Koche die Makkaroni nach Packungsanleitung al dente.
Schneide die Zucchini und die Paprika in mundgerechte Stücke. Schäle und würfele den Knoblauch und die Zwiebel.
Brate die Zucchini und Paprika in etwas Olivenöl an und würze sie mit Salz und Pfeffer sowie der Hälfte des Knoblauchs.
Fülle eine Dose Tomaten in eine Auflaufform, zusammen mit der Zwiebel, dem restlichen Knoblauch, etwas Olivenöl, Salz und Pfeffer und einigen zweigen Thymian. Vermische alles gut.
Lass die Nudeln abtropfen und fülle sie zur Soße, genau wie das Gemüse und die Oliven. Vermische alles und zupfe den Mozzarella darüber.
Backe den Auflauf bei 170 °C Umluft für 20 Minuten golden.